Faculdade de Ciências Agronômica (FCA) foi fundada no ano de 1965, na antiga Faculdade de Ciências Medicas e Biologicas de Botucatu (FCMBB), localizada no distrito de Rubião Júnior, no município de Botucatu. Em 1978, se tornou a Faculdade de Ciências Agronômica (FCA), se mudando para a Fazenda Lageado, no mesmo município de Botucatu.

Atualmente a faculdade oferece 2 cursos de graduação: Agronomia e Engenharia Florestal. E oferece 5 programas de Pós-Graduação: Agricultura, Energia na Agricultura, Irrigação e Drenagem, Horticultura e Proteção de Plantas.